O presente projeto tem como objetivo subsidiar a tomada de decisão ao abordar a modelagem e previsão na Grande João Pessoa (composta pelos municípios de João Pessoa, Cabedelo, Bayeux, Santa Rita e Conde) sobre os casos de ocorrência de COVID-19, utilizando-se de metodologias recentes de tomada de decisão espacial, modelagem e previsão da curva epidemiológica.
As semanas compreendidas neste projeto são aquelas que incluem os meses de julho de 2020 a março de 2021, iniciando-se na semana epidemiológica 27/2020.
Monitoramento
- Análise Descritiva
- Mapeamento dos Dados Epidemiológicos da Grande João Pessoa
- Análise Espacial
Análise Descritiva
↑
Gráficos de Casos Novos e Acumulados
Mapeamento de Dados Epidemiológicos da Grande João Pessoa
↑
O mapeamento dos dados epidemiológicos da Grande João Pessoa, que inclui municípios de João Pessoa, Cabedelo, Bayeux, Santa Rita e Conde, estão apresentados em mapas que contém os totais de casos e óbitos acumulados por mês e por semana epidemiológica.
Mapas do Total Acumulado de Casos e Óbitos por Mês
agosto/2020 |
setembro/2020 |
outubro/2020 |
novembro/2020 |
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Mapas dos Casos Acumulados por Semana Epidemiológica
Semana 27/2020 |
Semana 28/2020 |
Semana 29/2020 |
Semana 30/2020 |
Semana 31/2020 |
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Semana 32/2020 |
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Semana 37/2020 |
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Semana 52/2020 |
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Semana 04/2021 |
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Mapas dos Casos Novos por Semana Epidemiológica
Semana 27/2020 |
Semana 28/2020 |
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Semana 30/2020 |
Semana 31/2020 |
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Semana 32/2020 |
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Semana 37/2020 |
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Análise Espacial
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A análise espacial está sendo realizada a partir da utilização de duas técnicas: a razão de incidências espacial (RIE) e a detecção de aglomerados espaciais utilizando o método de varredura Scan Circular.
A Razão de Incidências Espacial (RIE) mostra a relação de duas incidências na ocorrência de um fenômeno, ou seja, uma incidência de uma localidade em relação a uma incidência em toda uma região geográfica de interesse. A primeira mostra a relação entre os casos observados em sub-área (nesse caso, a grande João Pessoa) em relação à sua população sob risco nessa mesma sub-área. A incidência em toda uma região geográfica mostra a contribuição relativa de todos os casos observados em toda essa região geográfica (nesse caso, a grande João Pessoa) e sua população total sob risco (Lima et. al. (2019a), Lima et. al. (2019b)).
Matematicamente, a RIE é dada pela equação:
onde: uma região geográfica de interesse é composta por n sub-áreas denotadas por {a1,a2, ..., an}, as quais, nesse caso são os estados brasileiros. A variável V denota o número de casos que ocorrem em cada uma das sub-áreas ai e a variável X denota a população de cada uma dessas sub-áreas.
A interpretação da RIE é simples e permite uma comparação direta entre as sub-áreas ai. O Quadro abaixo mostra sua interpretação.
RIE (ai) = 0 |
Quando não foram registrados casos naquela sub-área |
0,5 < RIE(ai) < 0,5 |
A RIE naquela sub-área é menor do que a metade da incidência em toda a região geográfica |
0,5 ≤ RIE(ai) < 1,0 |
A RIE naquela sub-área é maior ou igual à metade e inferior à incidência em toda a região geográfica |
1,0 ≤ RIE(ai) < 1,5 |
A RIE naquela sub-área é maior ou igual à incidência em toda a região geográfica, mas não a excede em mais do que 50% |
1,5 ≤ RIE(ai) < 2,0 |
A RIE naquela sub-área é maior ou igual à 1,5 vezes a incidência em toda a região geográfica, mas não a excede em mais do que 2 vezes |
RIE(ai) ≤ 2,0 |
A RIE naquela sub-área é é maior ou igual à 2,0 vezes a incidência em toda a região geográfica |
A varredura Scan Circular permite visualizar os centros dos municípios que possuem valores diferentes e significativos do ponto de vista estatístico e que compõem aglomerados espaciais. Isso significa que os municípios com valores altos e estatisticamente significativos compõem grupos no mapa (mesmo que seja de apenas um município). Mais detalhes técnicos em: Lima et. al. (2019b). No mapa, destacam-se na cor vermelha os municípios significativos.
Outros resultados do uso das técnicas da RIE e Scan Circular também podem observados no projeto Mapeamento e Tomada de Decisão sobre os casos de COVID-19 (Sars-CoV-2) no Brasil.
RIE de Casos Acumulados por Mês
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RIE de Casos Acumulados por Semana Epidemiológica
Semana 27/2020 |
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RIE de Casos Novos por Semana Epidemiológica
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Detecção de Aglomerados Espaciais a Partir dos Casos Acumulados por Mês
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Detecção de Aglomerados Espaciais a Partir dos Casos Acumulados por Semana Epidemiológica
Semana 27/2020 |
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Detecção de Aglomerados Espaciais a Partir dos Casos Novos por Semana Epidemiológica
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Previsão
↑
A previsão dos casos foi testada a partir do uso de modelos de regressão polinomial.
O modelo de Regressão Polinomial visa obter de um modelo para os
n dados observados, ajustando um polinômio de grau
k, no qual a variável dependente
Y é colocada como função de apenas uma variável independente
X, ou seja:
Yi = β0 + β1Xi + β2Xi2 + ... + βkXik , i = 1, ..., n
onde: Y
i são os valores resposta da variável de interesse; X
i são os valores da variável explicativa; β
k são os parâmetros que ponderam a contribuição da variável X no modelo.
O Coeficiente de determinação R
2 é uma medida de ajuste do modelo, ele indica a quantidade da variância dos dados que é explicada pelo modelo. O R
2 varia entre os valores 0 e 1. Quanto mais próximo de 1, mais a variável X explica a variável Y.
Os modelos que tiveram melhor desempenho foram com k = 7 para Santa Rita e k = 8 para as demais cidades e a Grande João Pessoa.
Para estabelecer os modelos de regressão na descrição das curvas de crescimento do número de casos acumulados da Covid-19 nos municípios da Grande João Pessoa (PB), considerou-se as ocorrências de casos dos meses de março de 2020 a janeiro de 2021, que compreende as semanas epidemiológicas 13 a 53 do ano 2020 e 01 a 11 do ano 2021. Os modelos obtidos para cada município, alcançaram coeficientes de determinação (R
2) ajustado variando acima de 0,99 para todos os municípios envolvidos na pesquisa. Coeficientes de determinação com valores próximos a 1, possibilitam estimativas de valores de períodos (semanas epidemiológicas) futuros, muito próximos dos valores reais nos municípios pesquisados. Cada município descreveu uma curva de crescimento diferenciada para o número de casos acumulados, descritos por meio de seus respectivos polinômios.
Os dados disponibilizados via Web pela Secretaria de Saúde do Estado da Paraíba estão sendo utilizados para calibração dos modelos para cada município. Foram usadas as Semanas Epidemiológicas 13 a 53 de 2020 e as Semanas Epidemiológicas 01 a 11 de 2021 para a previsão do número acumulado de casos nas Semanas Epidemiológicas 12 e 13 de 2021. Os resultados da previsão pelos Modelos são:
Município |
Coeficiente de Ajuste R2 ajustado |
Previsão do número de casos acumulados (semana 12) |
Previsão do número de casos acumulados (semana 13) |
Bayeux |
0,9968 |
[4378; 5021] |
- |
Cabedelo |
0,9983 |
[5901; 6525] |
[5673; 6808] |
Conde |
0,9991 |
[1701; 1821] |
[1746; 1965] |
João Pessoa |
0,9997 |
[66593; 69268] |
[66467; 71331] |
Santa Rita |
0,9983 |
[5978; 6533] |
[6065; 6931] |
Grande João Pessoa |
0,9997 |
[85318; 88843] |
[85096; 91507] |
Gráficos dos Modelos
azul = limite inferior;
verde = limite superior;
vermelho = real;
preto = resposta média do modelo
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para Bayeux(PB)
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para Cabedelo(PB)
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para Conde(PB)
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para João Pessoa(PB)
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para Santa Rita(PB)
Modelo de Previsão de Casos Acumulados de COVID-19 para Grande João Pessoa(PB)
Equipe
- Prof. Dr. Ronei Marcos de Moraes (Coordenador)
- Profa. MSc. Ana Cláudia Oliveira de Melo
- Claryce Rebeca de Sousa Feitosa
- Dra. Danielly Cristina de Souza Costa Holmes
- MSc. Francisco Vilar de Araújo Segundo Neto
- Dra. Laísa Ribeiro de Sá
- Prof. Dra. Liliane dos Santos Machado
- Dra. Luciana Moura Mendes de Lima
- Enf. Luiz Henrique da Silva
- Prof. Dr. Pedro Costa Guedes Viana
- Prof. Dr. Richarde Marques da Silva
- Prof. Dr. Rodrigo Pinheiro de Toledo Vianna
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